Filmin başında Neo kötü bir rüya görerek uyanır. Rüyasında Trinity ajanla mücadele eder ancak çıkış yolu kalmayınca bir gökdelenin penceresinden atlar. Bu sahne filmin sonunda gerçekten de yaşanacaktır. Neo'ya 2 ayrı kapı gösterilecektir. Neo, ya Trinity'i kurtaracaktır ya da insanların makinelerden kaçtıkları yer altındaki Zeon'u. Neo ikisinden birini seçmeye Mimar tarafından zorlanacaktır. Şimdi filmin sonunu gösteren bu sahneyi burada bırakıp filmin konusuna dönelim. Neo, kendisine ulaşması için kahinden haber beklemektedir. Makineler yerin altındaki Zeon'a ulaşmak için yeri kazmaktadır ve Zeon'a hızla yaklaşmaktadır. Morpheus'a göre makinelerle olan savaştan kurtuluşun tek yolu kehanettir. İnandığı kehanet gerçekleşecektir. Kehanete göre seçilmiş kişi yani Neo, Zeon'u makinelerden kurtaracaktır. Aksi halde makineler Zeon'a ulaşacak ve Zeonla birlikte makinlerden kaçmayı başarmış tüm insanlığı yok edecektir. Morpheus, makinelerin yeri k...
"Oku, düşün, araştır, sorgula, anla, kendini bil..."